《中国病毒病杂志》  2011年02期 110-115   出版日期:2011-04-01   ISSN:2095-0136   CN:11-5969/R
 一种HIV-1耐药基因型检测方法的一致性分析


 

抗HIV-1病毒药物的广泛使用,使患者的生活质量得到改善,但与此同时,耐药毒株的产生成为治疗失败的主要原因之一。HIV-1耐药性检测结果对患者治疗方案的选择具有重要的指导作用。HIV-1耐药性检测通常应用于急性或近期感染以及抗病毒药物治疗失败的患者,并且也越来越多地应用于慢性感染未经治疗的患者[1]。HIV-1耐药性检测包括基因型检测和表型检测两种。基因型检测以检测耐药相关突变为手段,与表型检测方法相比,具有检测周期短、价格低等优势,因此被广泛使用。

目前,经美国FDA批准的有TruGene和ViroSeq两种用于HIV-1耐药基因型检测的商品化试剂,但由于其价格昂贵,在国内外特别是在发展中国家的推广上受到限制,而且这两种检测方法也存在一些问题,扩增和测序引物还需要改善以适应所有亚型的检测[2]。于是一些实验室自己建立检测方法(in-house)进行耐药检测。已经报道了一些自建的方法,对不同亚型的样品都有很高的敏感性和扩增率[3],与ViroSeq检测方法的比较中,在耐药相关突变位点的判断上也取得了很好的一致性[4-5]。但是对于in-house方法重复检测的一致性并没有得到很好的说明。

本研究旨在通过对同一样品由不同操作人员使用in-house方法进行两次检测得到的序列进行比对和耐药突变位点的分析,评价在目前使用的一种基因型耐药检测in-house方法的结果一致性。