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2017年昆明市手足口病患儿柯萨奇病毒 A 组6型 VP1区基因 特征分析(PDF)

《中国病毒病杂志》[ISSN:2095-0136/CN:11-5969/R]

期数:
2020年第5期
页码:
350-358
栏目:
论著
出版日期:
2020-10-29

文章信息/Info

Title:
Cenetic characteristics of the VP1 region of coxsackievirus A6 strains isolated from children with hand.foot and mouth disease in Kunming city in China
作者:
李楠伏晓庆向以斌寸建萍姜黎黎周晓芳田炳均
云南省疾病预防控制中心,云南 昆明 650022
Author(s):
-
关键词:
手足口病柯萨奇病毒 A 组6型VP1基因昆明市
Keywords:
Handfootandmouthdisease(HFMD)CoxsackievirusA6VP1geneKunmingcity
分类号:
R373.2
DOI:
-
文献标识码:
A
摘要:
目的 分 析 2017 年 昆 明 市 手 足 口 病 (hand,footandmouthdisease)患 儿 柯 萨 奇 病 毒 A 组 6 型 (coxsackievirusA6,CVA6)VP1区 (915bp)基因特征。方法 对2017年云南省手足口病实验室监测系 统分离到的昆明市21株 CVA6毒株的 VP1区基因进行扩增和测序,并将测得的序列与 NCBI数据库中的 序列进行比对,运用 MEGA5.2软件构建系统进化树,进行分子流行病学分析。结果 昆明市21株 CV A6毒株之间的核苷酸和氨基酸相似性分别为92.24%~100.00%和96.72%~100.00%。与原型株 Gdula (AF081297)的核苷酸和氨基酸相似性为81.53%~83.50%和94.10%~96.39%。基于 VP1分型,昆明市 21株 CVA6毒株均为 D3a亚型,并分成2个不同的进化分支,其中20株为分支1 (cluster1),1株为分 支2 (cluster2)。结论 2017年昆明市引起手足口病的CVA6毒株为 D3a亚型,流行存在2个传播链,应 进一步加强对昆明市 CVA6的持续监测。
Abstract:
ToanalyzethegeneticcharacteristicsofVP1region(915bp)ofcoxsackievirusA6(CV A6)strainsisolatedfromhand,foot,andmouthdisease(HFMD)inKunmingcityofChinain2017. TheVP1genesof21KunmingstrainsofCVA6isolatedfrom HFMDsurveillancesystemin2017were amplifiedandsequenced,alongwiththereferencestrainsfrom NBCIdatabase,thephylogenetictreewascon structedusingMEGA5.2software. KunmingstrainsofCVA6shared92.24%100% homologies innucleotideand96.72%100%inaminoacid.Comparedtotheprototypestrain(Gdula,AF081297),theho mologieswere81.53%83.50%innucleotideand94.10%96.39%inaminoacid.AllKunmingCVA6strains weregroupedasD3asubgenotypeandcanbefurtherdividedinto2geneticclusterswith20strainsincluster1 whileonlyonestrainincluster2.In2017,allHFMDcasescausedbyCVA6strainsinKun mingcityofChinaweregroupedtoD3asubgenotype,andthereweretwoCVA6transmissionchains.

参考文献/References

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备注/Memo

备注/Memo:
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更新日期/Last Update: 1900-01-01