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云南省人类埃可病毒25型的基因特征分析(PDF)

《中国病毒病杂志》[ISSN:2095-0136/CN:11-5969/R]

期数:
2020年第5期
页码:
346-349
栏目:
论著
出版日期:
2020-10-29

文章信息/Info

Title:
Gentic analysis of echovirus 25 isolated from Yunnan province of China
作者:
罗春蕊1徐敏2伏晓庆1周晓芳1寸建萍1向以斌1田炳均1
Author(s):
-
关键词:
1. 云南省疾病预防控制中心云南 昆明 6500222. 云南省科学技术院云南 昆明 650000
Keywords:
Echovirus25VP1geneMolecularepidemiology
分类号:
R512
DOI:
-
文献标识码:
A
摘要:
目的 对云南省2006-2014年从急性弛缓型麻痹 (acuteflaccidparalysis,AFP)、手足口病 (hand, footandmouthdisease)、病毒性脑炎 (viralmeningitis,VM)病例和健康儿童中分离到的15株人类埃可病 毒25型 (echovirus25,E25)VP1区的基因特征进行分析。方法 对云南省分离到的15株 E25毒株进行 血清中和试验和基因测序鉴定并对其完整 VP1区基因进行逆转录聚合酶链反应及定型,构建其亲缘性进化 树揭示其基因特征。结果 2006-2014年云南15株 E25毒株的基因进化分析表明,14株分布在基因型 B 分支2(lineage2)的簇1 (cluster1),1株分布在簇2 (cluster2)。云南株与原型株JV4株的核苷酸差异率 为19.91%,氨基酸差异率为5.56%。结论 基因进化分析结果表明15株云南 E25病毒株为基因型 B,其 中14株为分支2的簇1,只有1株为簇2,簇1毒株是云南省主要流行株。
Abstract:
Tostudythegeneticfeaturesofechovirus25 (E25)isolatedfrompatientswithacute flaccidparalysis(AFP),hand,footandmouthdisease(HFMD),viralmeningitis(VM)andhealthychildren inYunnanprovinceofChinabetween2006and2014. Theserotypesof15strainsofE25werede terminedbyneutralizationtestandVP1sequencing.Thephylogenetictreewasconstructedtodemonstratethe geneticcharacterizationofE25virusesinYunnanprovinceofChina. Atotalof15strainsofE25vi rusisolatedfrom 2006to 2014in Yunnan province wereidentified by neutralizationtestand sequen cing.Phylogeneticanalysisshowed14Yunnanstrainsbelongedtocluster1oflineage2ingenotypeBwhileon lyonestrainbelongedtocluster2oflineage2ingenotypeB.Thenucleotide(nt)andaminoacid(aa)diversi tiesbetweenYunnanstrainsandtheprototypestrainJV4were19.91%and5.56%. Phyloge neticanalysisshowsthat15 Yunnanstrainsbelongtolineage2ofgenotypeB,ofwhich,14strainsbelongto cluster1,only1strainbelongtocluster2.Cluster2virusisthepredominantcirculatingvirusinYunnanprovince.

参考文献/References

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备注/Memo

备注/Memo:
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更新日期/Last Update: 1900-01-01