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贵州省2015年急性弛缓性麻痹病例中人类肠道病毒的鉴定及 VP1区基因特征分析(PDF)

《中国病毒病杂志》[ISSN:2095-0136/CN:11-5969/R]

期数:
2020年第5期
页码:
337-341
栏目:
论 著
出版日期:
2020-10-29

文章信息/Info

Title:
Identification and genetic characteristics in VP1 gene of enteroviruses isolated from acute flaccid paralysis cases at Guizhou province of China,2015
作者:
王宇1任刚2苏飞2王寅寅2唐小敏2
1. 贵阳市第一人民医院检验科,贵州 贵阳 550002;2. 贵州省疾病预防控制中心,贵州 贵阳 550004
Author(s):
-
关键词:
急性弛缓性麻痹非脊髓灰质炎肠道病毒基因特征柯萨奇病毒 B组3型
Keywords:
AcuteflaccidparalysisNonpolioenterovirusGeneticcharacteristicsCoxsackievirusB3
分类号:
R373.2
DOI:
-
文献标识码:
A
摘要:
目的 对贵州省2015年急性弛缓性麻痹 (acuteflaccidparalysis,AFP)病例中非脊髓灰质炎肠道病 毒 (nonpolioenterovirus,NPEV)进行鉴定分析,并对柯萨奇病毒 B组3型 (coxsackievirusB3,CVB3) 的 VP1编码区 (915bp)进行种系进化分析。方法 2015年贵州省共报告15岁以下 AFP病例212例。采 用人类横纹肌肉瘤 (humanrhabdomyosarcoma,RD)细胞和表达人类脊髓灰质炎病毒受体的小鼠肺细胞系 (mousecelllineexpressingthegeneforthehumancellularreceptorforpoliovirus,L20B)对 AFP病例粪便 标本进行病毒体外扩增,对分离到的 NPEV 毒株进行 VP1区序列测定分型。通过 MEGA7.0软件构建遗 传进化树进行基因特征分析。结果 212例 AFP病例中分离到 NPEV 毒株27株 (12.7%,27/212),共包 括10个血清型,其中人类肠道病毒 (humanenterovirus,EV)A 组包括4个血清型,共17株;EVB组包 括6个血清型,共10株,其中5株为 CVB3,属于 D2基因亚型,并有 D2a和 D2b两个分支;未分离到 EVC与 EVD组毒株。结论 2015年贵州省 AFP病例的病原谱包含多种型别的肠道病毒,CVB3毒株中 的 D2基因亚型占主导流行。
Abstract:
Toidentifyandanalyzethenonpolioenterovirus (NPEV)inacuteflaccidparalysis (AFP)casesinGuizhouprovinceofChinain2015andrunphylogeneticanalysisfortheVP1codingregion (915bp)ofcoxsackievirusB3 (CVB3). In2015,212 AFPcasesbelow 15yearsold were reportedinGuizhouprovinceofChina.virusamplificationwasconductedwithfecalsamplesfromAFP casesusinghumanrhabdomyosarcoma(RD)andmousepulmonarycelllineexpressingthegeneforthehuman cellularreceptorforpoliovirus(L20B).TheisolatedNPEVstrainsweresubjectedtosequencingandgenoty pingoftheVP1region.TheMEGA7.0softwarewasusedtoestablishthephylogenetictreeforgeneticchar acterization. Therewere27NPEVstrains(12.7%,27/212)isolatedfromthe212AFPcases,in volving10serotypes;17strainswerehumanenterovirus(EV)Avirusesincludingfourserotypes;10strains wereEVBvirusesincluding6serotypes,amongwhich5wereCVB3strains,belongingtoD2subgenotype withtwobranches:D2aandD2b.NoEVCandDspecieswereidentifiedinthisstudy. The pathogenicspectrumofAFPcasesinGuizhouprovinceofChinain2015includedenterovirusofvarioussero types;geneticcharacteristicsshowedthatD2subgenotypeofCVB3strainswerethepredominantgenotype.

参考文献/References

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备注/Memo

备注/Memo:
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更新日期/Last Update: 1900-01-01