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2019年云南省昆明市2株柯萨奇病毒 A4毒株全基因 序列分析(PDF)

《中国病毒病杂志》[ISSN:2095-0136/CN:11-5969/R]

期数:
2020年第6期
页码:
439-444
栏目:
论著
出版日期:
2020-12-20

文章信息/Info

Title:
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作者:
丛山日许丹菡张名
Author(s):
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关键词:
柯萨奇病毒 A 组4型 (CVA4)手足口病全基因组肠道病毒进化分析遗传特性
Keywords:
CoxsackievirusA4HandfootandmouthdiseaseEntiregenomesequenceEnterovirusPhy logeneticanalysisGeneticcharacteristics
分类号:
R373.9
DOI:
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文献标识码:
A
摘要:
目的 对2019年云南昆明地区手足口病患者的粪便进行病毒分离并对毒株进行全基因组序列测定和 遗传特性分析。方法 利用人类横纹肌肉瘤细胞 (humanrhabdomyosarcoma,RD)进行病毒分离,提取病 毒的 RNA 序列进行逆转录聚合酶链反应 (reversetranscriptionpolymerasechainreaction,RTPCR)并测 序,利用 MEGA6.06、Simplot3.5.1和 Geneious9.1.4等软件对毒株的全基因组序列进行分析。结果 KR3/YN/CHN/2019 (简称 KR3)和 KR110/YN/CHN/2019 (简称 KR110)分离株经测序比对为柯萨奇 病毒 A 组4型 (coxsackievirusA,CVA4),全基因序列长度分别为7434个核苷酸和7436个核苷酸,编 码2201个氨基酸;全基因核苷酸一致性及氨基酸同源性分别为92.4%和98.4%。2株 CVA4云南分离株 与大多数中国流行株在同一分支,均属于C2亚型。结论 KR3和 KR110分离株为CVA4,与中国CVA4 流行株一致,同属于 C2亚型。
Abstract:
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参考文献/References

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备注/Memo

备注/Memo:
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更新日期/Last Update: 1900-01-01