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2014-2018年云南省文山州柯萨奇病毒A10型VP1区基因特征分析(PDF)

《中国病毒病杂志》[ISSN:2095-0136/CN:11-5969/R]

期数:
2020年第2期
页码:
109-113
栏目:
论著
出版日期:
2020-03-01

文章信息/Info

Title:
Gentic characteristics of coxsackievirus A10 during 2014 and 2018 in Wenshan prefecture of Yunnan,China
作者:
周雪花伏晓庆李楠
1. 云南省文山州疾病预防控制中心,云南 文山 663099;2. 云南省疾病预防控制中心,云南 昆明 650022
Author(s):
-
关键词:
柯萨奇病毒 A10型VP1基因基因特征分析
Keywords:
Coxsackievirus A10VP1 geneGenetic characteristics analysis
分类号:
R373.2+3
DOI:
-
文献标识码:
摘要:
目的 对2014-2018年云南省文山州从手足口病病例中分离的柯萨奇病毒 A10型 (coxsackievirus A10,CVA10)完整 VP1区基因 (894bp)进行基因特征分析。方法 用486/488和487/489引物扩增 CVA10VP1区5′端和3′端基因,用Sequencher4.0软件对序列进行拼接和编辑,得到 CVA10VP1区全 序,并将测得的序列与 NCBI数据库中的序列进行比对,构建系统进化树,进行基因特征及分子流行病学 分析。结果 2014-2018年云南省文山州手足口病实验室监测系统从2774份标本中分离到197株肠道病 毒阳性标本,病毒分离率为7.10% (197/2774),其中检出8株 CVA10。基于 VP1分型,8株毒株序列 均为基因型 C,其中4株为分支1;2株为分支2;2株为分支3。8株毒株 VP1序列的核苷酸一致性为 93.07%~94.10%,氨基酸一致性为97.74%~98.41%,与原型株 Kowalik (基因库编号:AF081300)的 核苷酸一致性为76.01%~76.65%,氨基酸一致性为91.78%~92.26%。结论 2014-2018年云南省文 山州分离的 CVA10毒株均为基因型 C,并可分为3个进化分支,应加强对 CVA10的持续监测和基因特 征分析。
Abstract:
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参考文献/References

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备注/Memo

备注/Memo:
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更新日期/Last Update: 2020-03-01