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一株柯萨奇病毒A 组6型毒株RYNA1205的分子特征及其在KMB17细胞上的遗传稳定性研究(PDF)

《中国病毒病杂志》[ISSN:2095-0136/CN:11-5969/R]

期数:
2020年第2期
页码:
102-108
栏目:
论著
出版日期:
2020-03-01

文章信息/Info

Title:
Molecular characteristics of a coxsackievirus A6 strain RYN-A1205 and its genetic stability in KMB17cells
作者:
刘红波张捷许丹菡
中国医学科学院 北京协和医学院医学生物学研究所 云南省重大传染病疫苗研发重点实验室,云南 昆明 650118
Author(s):
-
关键词:
柯萨奇病毒 A 组6型分子特征KMB17细胞遗传稳定性
Keywords:
coxsackievirus A6Molecular characterizationKMB17 cell-adapted strainGenetic stability
分类号:
:R373.22
DOI:
-
文献标识码:
A
摘要:
目的 研究1株手足口病相关柯萨奇病毒 A 组6型 (coxsackievirusA6,CVA6)毒株 RYNA1205 的分子特征及其在 KMB17细胞中连续传代的遗传稳定性。方法 利用 MEGA7.0软件并采用 neighbor joining法对 RYNA1205株及65株 CVA6代表株基于全长 VP1序列进行种系进化分析。另外,将 RYN A1205株以 MOI=1接种至 KMB17细胞中于37℃连续传代培养,提取适应前及适应后第1、5、10、15代 毒株的 RNA,以其为模板,RTPCR分段扩增全基因组序列并进行测序分析。结果 RYNA1205株属于 D3基因亚型中的 D3a分支,能较好地适应 KMB17细胞。与适应前毒株相比,适应后毒株共发生15个碱 基突变,造成12个氨基酸替换。适应后各代次病毒全基因核苷酸及氨基酸序列同源性分别为99.97%~ 100%和99.90%~100%,其中,P10代在 VP2和3D编码区各发生1个氨基酸的替换,P15代氨基酸突变 情况与 P10代一致。结论 RYNA1205株与我国近几年的 CVA6内地流行株在进化树中属于同一分支, 在 KMB17细胞上适应后保持良好的遗传稳定性,这为后续 CVA6疫苗的研发提供参考。
Abstract:
Coxsackievirus A6;

参考文献/References

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备注/Memo

备注/Memo:
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更新日期/Last Update: 2020-03-01