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2019年云南省怒江州柯萨奇病毒 A 组16型的分子流行病学研究(PDF)

《中国病毒病杂志》[ISSN:2095-0136/CN:11-5969/R]

期数:
2021年第3期
页码:
168-171
栏目:
标准与指南
出版日期:
2021-08-01

文章信息/Info

Title:
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作者:
罗定富张丽芬徐敏
1. 德宏州疾病预防控制中心,云南 芒市 678400;2. 云南省疾病预防控制中心,云南 昆明 650022; 3. 云南省科学技术院,云南 昆明 650000
Author(s):
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关键词:
柯萨奇病毒 A 组16型 (CVA16)VP1基因基因特征分析分子流行病学
Keywords:
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分类号:
R512.5
DOI:
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文献标识码:
摘要:
目的 了解2019年云南省怒江州柯萨奇病毒 A 组16型 (coxsackievirusA16,CVA16)毒株的分 子流行病学特征,积累 CVA16的基因信息。方法 对2019年云南省怒江州疾病预防控制中心手足口病实 验室从手足口病患者中检测到的58株 CVA16毒株进行 VP1区基因扩增、测序,采用 Mega5.2软件和邻 位相接法 (neighborjoiningmethod)进行基因特征和分子流行病学分析。结果 2019年云南省怒江州 CV A16毒株 VP1区基因由891个核苷酸组成,共编码297个氨基酸。基因进化分析表明2019年怒江州58株 CVA16毒株中,57 株 (98.28%,57/58)为 B1b亚 型,1 株 (NJ134/YN/CHN/2019,简 称 NJ134)为 B1c亚型 (1.72%,1/58),未 分 离 到 B1a 亚 型 和 其 他 基 因 型。NJ134 株 与 印 度 株 的 核 苷 酸 一 致 性 为 95.30%~97.60%,氨基酸同源性为99.70%~100.00%,NJ134株最接近印度株,推测其来自印度。结论 2019年云南省怒江州 CVA16毒株以 B1b亚型为主,同时发现了1株 B1c亚型,为国内首次发现。 关键词:柯萨奇病毒 A 组16型 (CVA16);VP1基因;基因特征分析;分子流行病学
Abstract:
TostudythemolecularepidemiologyofcoxsachievirusA16(CVA16)fromNujiangpre fectureofYunnanprovinceofChinain2019. TheVP1geneof58strainsofCVA16identified fromNujiangprefecturewereamplified,sequencedandtheirgeneticcharacteristicsandmolecularepidemiology wereanalyzed. TheVP1geneofCVA16wascomposedof891nucleotides(nt),codingfor297 aminoacids(aa).Phylogeneticanalysisshowedthat,ofthe58strainsofCVA16from Nujiangprefecturein 2019,57strainswereB1bsubgenotype,accountingfor98.28% (57/58);onestrain(NJ134YNCHN2019, NJ134)wasB1c,accountingfor1.72% (1/58),noB1aandothergenotypeswereidentified.Thentandaa identitybetween NJ134andtheIndian B1cstrains were95.30%97.60% and99.70%100.00%,respectively. NJ134wasmostlyclosedtoIndianstrains. B1bsubgenotypeofCVA16caused HFMDoc curredinNujiangprefecturein2019.Meanwhile,onestrainofB1csubgenotypewasdetected.Thisisthefirst reportofB1csubgenotypeinChina.

参考文献/References

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备注/Memo

备注/Memo:
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更新日期/Last Update: 2021-08-06